Hallinnoijat ry:llä on erikseen merkkiohjesääntö, joka määrittää millaisia ansio- ja kunniamerkkejä järjestö voi myöntää ansioituneille jäsenilleen tai järjestön toimintaa jotenkin edistäneille tahoille. Ansiomerkit myöntää Hallinnoijat ry:n hallitus ylioppilaskunnan vuosijuhlaviikolla, eli helmikuussa. Hallinnoijat ry voi myös nimetä keskuudestaan kunniajäseniä.

Ansioituneet:

2009

Kevätkokous 2009 valitsi hallituksen esityksestä Hallinnoijat ry:n kunniajäseneksi Isa-Tuuli Tuomisen. Tuominen on toiminut halhallituksen jäsenenä ja Hallareiden 25-vuotisjuhlien vastaavana. Tämän lisäksi Tuominen on tehnyt pitkän päivätyön mm. toimimalla ylioppilaskunnan edustajistossa ja hallintotieteiden tiedekuntaneuvostossa.

2010

Hallinnoijat ry myönsi kultaisen ansiomerkin Leeni Raudalle (ent. Terkko) Raudan toiminta Hallinnoijat ry:n perustamisessa ja ensimmäisena puheenjohtajana on ollut merkittävää yhdistyksen olemassaololle ja toiminnan jatkuvuudelle.

Hopeinen ansiomerkki myönnettiin Elisa Kannastolle sekä Marja Vettenrannalle. Kannasto on toiminut pitkäaikaisesti aktiivisesti Hallinnoijat ry:n hyväksi ollen aktiivinen ja luotettava. Kannasto on edistänyt Hallinnoijat ry:n toimintaa osallistumalla tapahtumien järjestämiseen. Vettenranta on toiminut ansiokkaasti Hallinnoijat ry:n puheenjohtajana. Vettenranta on näin ollen edistänyt yhdistyksen toimintaa omalla puheenjohtajakaudellaan sekä nykypäivänä.